Genotipia | Cursos de Genética y Genómica Foros Preguntas y respuestas PCR en tiempo real para detectar Covid-19 en comunidades.

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  • #42838
    Oscar
    Participante

    Hola, actualmente tengo responsabilidad en el ayuntamiento de una pequeña localidad, y me gustaría elaborar una propuesta a la diputacion provincial, pero necesitaría conocer si mi propuesta tiene límites técnicos que podrían escaparseme.

    La PCR en tiempo real es una buena técnica para detectar la presencia de patógenos, y actualmente se usa para detectar Covid-19 en individuos. Sin embargo la competencia por conseguir los químicos necesarios está viniendo a resultar en una realización de pruebas muy insuficiente, que no nos permite identificar focos comunitarios de contagió ni entender la magnitud de la epidemia, llegando a barajar se un muy amplio rango de contagiados.
    La propuesta a la que pretendo dar forma es la de realización de test RT PCR en lugar de individuales, a grupos de población o localidades, de forma que tomando muestras de mucosa de todos los vecinos de una localidad por ejemplo, y con un solo ensayo, pueda descartarse o confirmarse la presencia de covid-19 dentro de la comunidad de vecinos de la localidad.
    ¿Es técnicamente viable realizar este tipo de ensayos? ¿Podríamos con un único termociclador y en dos horas averiguar que pueblos menores de la provincia de Teruel tienen presencia de covid-19 entre su población?
    Muchísimas gracias por la ayuda.

    #43327
    Genotipia
    Superadministrador

    Hola Óscar:

    Tu pregunta es muy interesante. De hecho en algunos lugares se ha propuesto analizar el agua de deshecho para detectar presencia del virus.
    Aquí tienes un enlace: https://www.dutchwatersector.com/news/sewage-water-as-indicator-for-spreading-of-covid-19

    En respuesta a tu pregunta, a nivel técnico, sí se pueden agrupar muestras de diferentes personas, aunque probablemente habría que poner a punto protocolos de optimización. Por ejemplo, habría que ver si cada muestra individual debe ser procesada de forma independiente para extraer ARN y luego agrupada en la amplificación por PCR. El tiempo de procesamiento individual sumaría tiempo al proceso total pero permitiría disponer de muestras individuales de cada persona para un posible reanálisis. Respecto a lo de las dos horas de tiempo, conviene recordar que al tiempo de PCR hay que añadir el tiempo de procesado de las muestras hasta que se realiza la PCR.

    ¡Un saludo!

    #43491

    Hola Oscar:

    También se está haciendo para optimizar los recursos en EEUU. Aquí tienes un enlace: https://medicalxpress.com/news/2020-04-pooled-samples-covid-track-early.html

    Es importante recordar que la PCR detecta la presencia del virus por lo que una vez recuperada la persona el resultado ya no será positivo.

    ¡Un saludo!

    #43495
    Oscar
    Participante

    Muchas gracias Amparo! Un contenido muy interesante!
    Es un verdadero placer recibir vuestros mensajes.

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