SARS-CoV-2: ¿Cómo detectar el nuevo coronavirus con ayuda de la genética?

Rubén Megía González

Hace poco publicamos en nuestro blog un nuevo post sobre la técnica bioquímica de la PCR, en el que explicamos en qué consiste. En este post os mostraré una de las variantes más utilizadas de la PCR, la RT-PCR cuantitativa, y cómo puede utilizarse para diagnosticar la infección por el coronavirus SARS-CoV-2.

 

Coronavirus SARS-CoV-2

El coronavirus SARS-CoV-2 es una especie de virus que apareció a finales de 2019 en el territorio de Wuhan, en China. En humanos este virus es capaz de causar diferentes afecciones respiratorias agudas y neumonías.

Los coronavirus son virus de ARN monocatenario positivo recubiertos por una estructura de glicoproteínas y lípidos. Eso quiere decir que, a diferencia de nosotros, los humanos, el SARS-CoV-2 tiene su material genético en forma de ARN. Pero… ¿la PCR sólo era capaz de amplificar el ADN, no? Cierto, las ADN polimerasas sólo pueden utilizar el ADN como molde y no el ARN. Entonces  ¿cómo es posible utilizar la PCR para detectar la infección por coronavirus? Pues… utilizando una variante de la PCR estándar, la RT-PCR, que se vale de la ayuda de un enzima muy particular, la transcriptasa inversa.

 

Obtención de la muestra y conversión de ARN a ADN mediante Transcriptasa inversa

La transcriptasa inversa es una ADN polimerasa de origen vírico un tanto especial. Mientras el resto de ADN polimerasas sólo puede obtener ADN a partir de una cadena de ADN, la transcriptasa inversa puede sintetizar ADN a partir de una molécula de ARN. ¡Como el de SARS-CoV-2!

Por tanto, el primer paso para detectar la infección por SARS-CoV-2 mediante PCR es la conversión del ARN monocatenario viral en ADN . Para ello, en primer lugar, se obtiene el material genético del virus a partir de un frotis de nariz o garganta del paciente a diagnosticar y se purifica. Debemos tener en cuenta que en la muestra estamos recogiendo también ARN humano, ARN bacteriano e incluso ARN de otros virus. ¡Menudo lío!

Acto seguido, la muestra de ARN obtenida y purificada se mezcla con la transcriptasa inversa (y otros reactivos), para obtener cadenas de ADN, que podemos cuantificar mediante una PCR cuantitativa. Aquí habrá ADN de muchos orígenes (humano, vírico y bacteriano), pero no todo se amplificará en la PCR, ya que es una técnica dirigida a ciertas secuencias específicas (en este caso, secuencias del ADN retrotranscrito del virus).

 

PCR cuantitativa

Como os comentaba en el post anterior sobre la técnica de la PCR, la PCR cuantitativa es una variante de la PCR que nos permite medir en tiempo real la cantidad de fragmentos de ADN que se van produciendo. Para poder cuantificar la muestra de un paciente en este tipo de PCR, se añaden al tubo de ensayo sondas que se unen únicamente a secuencias específicas del ADN retrotranscrito del virus y emiten fluorescencia. Por tanto, a mayor fluorescencia en la muestra, mayor cantidad de copias del ADN obtenido mediante la retrotranscripción del virus SARS-CoV-2.

Análisis de Resultados

Una vez se está produciendo la reacción de la PCR cuantitativa de la muestra purificada y retrotranscrita del paciente, podemos obtener los siguientes resultados:

Presencia de fluorescencia en la PCR cuantitativa:

Si se detecta un aumento de la fluorescencia durante la reacción de PCR, estamos ante un claro indicio de la presencia de SARS–CoV-2 en el paciente. Recordad que, en esta prueba diagnóstica, la fluorescencia es producto de la amplificación del ADN que hemos obtenido de la retrotranscripción del ARN del virus.

En este caso, diríamos que la prueba ha dado positivo, es decir, el paciente se encuentra infectado, en cierta medida, por SARS-CoV-2.

 

Ausencia de fluorescencia en la PCR cuantitativa:

Es posible que la prueba no detecte un aumento de la fluorescencia durante la reacción de PCR. En este caso, diríamos que la prueba ha resultado negativa y, por tanto, el paciente no se encuentra infectado por el virus SARS-CoV-2.

Limitaciones de la prueba mediante RT-PCR cuantitativa

Aunque la RT-PCR cuantitativa es una técnica muy interesante a la hora de detectar la infección por SARS-CoV-2 de los pacientes posiblemente infectados, presenta varias limitaciones asociadas que la hacen menos efectiva de lo que debería. 

La primera de las limitaciones de las pruebas diagnósticas de SARS-CoV-2 mediante RT-PCR cuantitativa es que solo pueden determinar la infección por SARS-CoV-2 en el momento de la prueba. Esto quiere decir que, utilizando esta técnica, no podemos saber si un paciente estaba infectado días antes de la prueba.

Otra de las limitaciones de la RT-PCR cuantitativa es la velocidad a la que se lleva a cabo. Aunque, por lo general, la PCR es una técnica bastante rápida para amplificar muestras de ADN, se demora varias horas hasta poder establecer unos resultados. El diagnóstico mediante este método es, por tanto, lento en la situación actual, en la que se necesitan resultados rápidos para poder controlar a los pacientes infectados.

Por último, aunque la RT-PCR cuantitativa es una técnica relativamente fiable, se pueden producir falsos positivos o falsos negativos. Se denominan falsos negativos a todos aquellos resultados negativos de pacientes infectados por SARS-CoV-2, mientras que se considera falso positivo a un resultado positivo de un paciente no infectado. Estos errores en el diagnóstico pueden determinar incorrectamente el seguimiento de los pacientes.

 

Test alternativos

Para suplir las limitaciones de la RT-PCR cuantitativa para el diagnóstico de infecciones de SARS-CoV-2, se están desarrollando diferentes técnicas de diagnóstico alternativas. Es el caso de los test de anticuerpos que se utilizan en el diagnóstico de SARS-CoV-2 o los test basados en CRISPR-Cas13 que se están desarrollando.

 

Test de anticuerpos

Los test de anticuerpos para la detección de SARS-CoV-2 son pruebas diagnósticas capaces de determinar si un paciente ha sido infectado y ya se encuentra inmunizado. Este tipo de pruebas consigue detectar los anticuerpos que el sistema inmunitario del paciente ha generado contra el virus. Una de las grandes ventajas de este test es el tiempo en el que se llevan a cabo, ya que solo se tardan unos 15 minutos en obtener resultados. 

El problema principal de este tipo de test es que no pueden determinar una infección reciente del paciente. Es decir, que si el paciente acaba de ser infectado por SARS-CoV-2  puede dar un resultado falso negativo, ya que la persona todavía no ha tenido tiempo para desarrollar anticuerpos frente al virus. Por ello, se recomienda como prueba complementaria a la RT-PCR cuantitativa.

 

Test basados en CRISPR-Cas13

Hace unos años (exactamente en 2017) un equipo de investigadores publicó en la revista Science una herramienta excelente que utilizaba CRISPR para detectar ácidos nucleicos. Estos científicos llamaron a esta técnica “SHERLOCK”. Actualmente se está desarrollando un test de detección de SARS-CoV-2 a partir de SHERLOCK. Sin embargo, todavía no se ha probado mediante ensayos clínicos, por lo que no podríamos considerarlo todavía una técnica de diagnóstico.

En este tipo de pruebas, gracias al sistema CRISPR-Cas13, podemos detectar la infección por SARS-CoV-2 a partir de una muestra de una forma rápida y visual. En este caso, el sistema se encuentra en laminillas de papel que, al ser sumergidas en una muestra se colorea, indicando la presencia de moléculas de ARN de SARS-CoV-2. Para que os hagáis una idea, visualmente es similar a una prueba de embarazo.

 

Otros test

Además de los test anteriores, algunos centros europeos, entre los que figura el Instituto Catalán de Nanociencia y Nanotecnología, están trabajando en un nuevo dispositivo que se espera que detecte la infección por coronavirus en menos de 30 minutos. Este nuevo dispositivo, al que los autores han llamado “CoNVat” se basa en tecnologia de microchip y guías de onda interferométricas (nanotecnología óptica) para detectar el virus.

 

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Bibliografia:

Enabling coronavirus detection using CRISPR-Cas13: Open-access SHERLOCK research protocols and design resources. Broad Institute: https://www.broadinstitute.org/news/enabling-coronavirus-detection-using-crispr-cas13-open-access-sherlock-research-protocols-and

Así son las pruebas PCR que se utilizan para detectar el coronavirus. Agencia SINC:

https://www.agenciasinc.es/Noticias/Asi-son-las-pruebas-de-secuenciacion-que-se-utilizan-para-detectar-el-coronavirus

Arranca el desarrollo de un nuevo y rápido detector del coronavirus. Agencia SINC:

https://www.agenciasinc.es/Noticias/Arranca-el-desarrollo-de-un-nuevo-y-rapido-detector-del-coronavirus?fbclid=IwAR2tciPhMJNVki2MROEbPQojXSzL2b7_fp8fIGEgB7JZ4z1H51ZWjT77WiU

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60 comentarios de “SARS-CoV-2: ¿Cómo detectar el nuevo coronavirus con ayuda de la genética?

  1. Heriberto Cuevas Lizárraga dice:

    muy didáctica la manera de describir estas nuevas herramientas de laboratorio que están de actualidad por parte del autor. Atte. H. Cuevas

  2. Leticia dice:

    En el 6to párrafo, ¿No debería decir: “Acto seguido, la muestra de ARN obtenida…” en lugar de “ADN”? Porque la muestra que se extrae del paciente y que luego purifica y mezcla con transcriptasa inversa es de ARN, no ADN. Saludos.

  3. Dr. Ernesto González González dice:

    Pienso que los materiales de genética que han sido puesto al alcance de los médicos acerca del nuevo coronavirus, ha sido muyyyy útil, y nos acerca más al mundo rico de la genética tan lejano a veces para nosotros los internistas en algunas circunstancias como esta. el papel de ustedes es digno de admirar y nos fortalece desde el punto de vista médico , enriquece nuestros conocimientos y con mucha satisfacción los felicito. estoy a diario al pendiente de lo que se publica en Genotipia desde hace mucho tiempo y siempre me he nutrido de sus aportes para ganar en cultura genética que lamentablemente a veces nos falta, porque considero que es una hermosa y útil especialidad en todos los campos de las ciencias. Felicitaciones.

  4. Roeris dice:

    Es realmente muy útil esta explicación, para conocer realmente como se aprovechan los mecanismos bioquímicos en algo tan importante como la detección del virus. Muchas Gracias por publicaciones de este tipo en tiempos de coronavirus.

  5. Pedro dice:

    Comentáis que “no todo se amplificará en la PCR, ya que es una técnica dirigida a ciertas secuencias específicas (en este caso, secuencias del ADN retrotranscrito del virus).”

    Pero…”aunque la RT-PCR cuantitativa es una técnica relativamente fiable, se pueden producir falsos positivos o falsos negativos”.

    ¿Cómo sabes que estás ante un falso positivo o negativo?
    ¿En qué porcentaje puede una PCR ser inespecífica y puede unirse a cualquier molécula de DNA, RNA contaminante o productos de amplificación inespecífica, aumentando la probabilidad de producir falsos positivos? ¿Podría unirse por error a una molécula de RNA de exosoma?

    • Genotipia dice:

      Hola Pedro:

      Normalmente en cada ensayo se incluyen controles que ayudan a determinar si puede haber habido algún problema en la reacción o en alguno de los reactivos. Por ejemplo se incluyen muestras que se sabe que tienen que dar positivo o negativo. A través de este tipo de pruebas en las que se conoce a priori el resultado se pueden estima la precisión y especificidad de análisis. Y se sabe la frecuencia con la que pueden producirse falsos positivos o falsos negativos. Cuando se utiliza la muestra de una persona, sin embargo, descartado cualquier problema en los reactivos o reacción (que se comprueba con los controles) no se puede saber con exactitud si es falso el resultado. La única posibilidad sería repetirlo e incluso podría ser que fuera positivo pero la cantidad de virus no llegara al mínimo detectado por la prueba.

      Respecto del porcentaje de una PCR a ser inespecífica, depende de varios factores. Las pruebas de detección diagnóstica se diseñan para ser muy específicas. EN primer lugar los cebadores son específicos del fragmento que se va a amplificar. Se pone mucho cuidado en ese diseño para optimizar que no amplifiquen otra cosa. Además, se utilizan temperaturas que favorezcan que solo se reconozcan moléculas de ADN complementario. Se intenta siempre minimizar que se una a otras secuencias. Se podría unir a ARN de exosoma si la secuencia es complementaria. Depende de la secuencia, no del origen del ARN.

      ¡Un saludo!

  6. Reyes dice:

    Buenas noches,necesito que alguien me ayude,le explico,me he hecho el test serológico y me ha dado positivo(no tengo sintomas),a los 12 días me lo he vuelto hacer pero uno cuantitativo y me dan el resultado y me dicen que ni lo tengo ni lo he tenido y me quedo de cuadros,igg 0.09 y igm 0.75.Nose que pensar, puede ser que no haya desarrollado anticuerpos y no sea inmune aunque lo hubiera tenido?Muchísimas gracias(esto es un sin vivir).

  7. José Angel dice:

    Muchas gracias por esa publicación tan esclarecedora.
    Cuál es la probabilidad de un falso positivo y la de un falso negativo para este metodo diagnóstico?

  8. JIMENA dice:

    Buena la información en relación al PCR, pero se puede declarar una pandemia sin tener la secuencia completa del virus?? y sin microscopías electrónicas, que deberían ser miles.. tengo esa duda,o confusión, que nadie me ha sabido responder!!

    • Rubén Megía González (Coordinador del área de formación) dice:

      Buenos días Jimena.

      Por definición, una pandemia es una enfermedad que se extiende a muchos países. Supongo que, si se logra determinar que una enfermedad es la misma en varios países, se puede declara una pandemia sin necesidad de obtener el genoma del virus.

  9. EDINSON MURILLO SEVILLANO dice:

    FELICITACIONES RUBEN,POR TAN VALIOSA INVESTIGACION CIENTIFICA , QUE NOS DESPEJA DUDAS ACERCA DE ESTA PANDEMIA. SALUDOS DESDE MACHALA ECUADOR. LCDO. EDINSON MURILLO SEVILLANO

  10. mirna leyton dice:

    Muy bien explicado, me asalta la duda en los test de IGG e IGM si es comprobada por esta infección exclusiva, quiere decir, si me hago un test rapido de IGG y me aparecen estos AC.. esto solo indica que estuve frente a una infección y mi cuerpo reaccionó; pero no necesariamente al sars-cov2

    • Genotipia dice:

      Hola Mirna:
      Los test son específicos para agente infeccioso. No obstante, habrá que tener en cuenta la sensibilidad y precisión de las pruebas rápidas que es menor que la de las pruebas ELISA tradicionales.

      ¡Un saludo!

    • Genotipia dice:

      Hola Ana: se hace para asegurar que un positivo es verdadero. Las recomendaciones oficiales piden hacer ensayo con una diana y confirmación con al menos otra. Si se realiza la prueba dirigida a tres dianas, el resultado es todavía más robusto.

      ¡Un saludo!

  11. Yissel dice:

    Excelente explicación, bastante clara. Una pregunta, cuando hablamos de la carga viral, esta se relaciona en lo absoluto con el valor umbral? Ct.

    • Rubén Megía González (Coordinador del área de formación) dice:

      Buenos días Yissel,

      ¡Muchas gracias por tus comentarios!

      Según he estado leyendo, así es.

  12. Antonio. dice:

    Me realizaron un exámen, pero el resultado es negativo, pero como ve en el análisis dice entre paréntesis (Presencia), que significa eso??? que e tenido covid-19 o que? esa es la duda que tengo. Esta prueba me la tomaron el día 04-06-2020. Gracias por lo que me pueda responder
    ANÁLISIS: SARS-coronavirus 2 ARN [Presencia]
    en muestra respiratoria por RT-PCR
    en tiempo Real
    METOD: RT-PCR En tiempo real
    RESULTADO: NEGATIVO –

    • Genotipia dice:

      Hola Antonio:

      Nuestra impresión es que ese (Presencia) hace referencia a qué es lo que se ha analizado en la prueba. Es decir, que la prueba ha analizado la presencia del Coronavirus. Lo que tiene que tener en cuenta es el resultado.
      No obstante, si tiene dudas, le recomendamos que consulte con los responsables de la prueba y ellos le expliquen en detalle el informe que ha recibido.

      ¡Un saludo!

  13. Ana Zambrano dice:

    Hay que tener cuidado Don los términos usados al momento de decir “PCR cuantitativa” ya que puede confundir a la gente pensando que se dirá la carga viral presente en el individuo. También se debería hablar e informar sobre número de copias y sobre genes analizados.

    • Genotipia dice:

      Hola Ana:

      La PCR cuantitativa es una técnica conocida por ese mismo nombre, que se explica en el post y se utiliza para detectar la presencia del coronavirus. Se ha intentado presentar de la forma más sencilla, por lo que no se menciona de forma específica el número de copias.
      Respecto a los genes analizados, cada sistema o kit utiliza diferentes. Para un conocimiento más profundo de los métodos de detectar el coronavirus responsable de la COVID-19 se puede consultar la guía que hemos publicado en: https://genotipia.com/guias/covid-19-tecnicas-de-deteccion/

      ¡Un saludo!

      • Valeria dice:

        Excelente todo, hasta los comentarios, me agrada mucho ver que hay expertos con tanta humildad para aceptar críticas y criterios, he dicho en un grupo de médicos informados que tengo dudas sobre una PCR positiva por no presentar ni un sólo síntoma y he sido altamente criticada…hasta en duda ponen que si soy médica…. Hay tanto eruditos que no aceptan ninguna otra postura.

  14. Luis dice:

    Buenas tardes, gracias por el clarificador articulo, es de agradecer. Una pregunta, me asaltan preguntas sobre la obtención de la secuencia del adn del coronavirus de cara a identificarlo en las pruebas tanto de pcr como de anticuerpos, ¿aquí en España se ha obtenido expresamente la secuencia o nos ha sido obtenida de otro lugar?, se obtiene en diferentes laboratorios y se compara?, como se sabe que es ese virus el coronavirus y no otro? , y tambien hace unas semanas habia voces que decian que ya habia mutado, habria que volver a secuenciarlo y supone cambiar los pcr?
    gracias

    • Genotipia dice:

      Hola Luis:

      Las primeras secuencias del coronavirus se obtuvieron de pacientes infectados. Esto fue lo que permitió identificarlo como nuevo agente infeccioso. Al comparar el ARN del virus (es un virus cuyo material hereditario está codificado en ARN) con los virus conocidos, sus características (unido a los datos de microscopía electrónica) lo definieron como coronavirus y permitieron desarrollar primeras pruebas de diagnóstico.

      Desde entonces se han obtenido muchas secuencias del virus de muchos países, que están depositadas en bases de datos públicas. Lo que hacen los desarrolladores de pruebas de diagnóstico es elegir las zonas menos variables del genoma del virus para diseñar los cebadores que se utilizan en la PCR. Por supuesto tienen que ser también regiones específicas que diferencien al virus de otros coronavirus, para asegurar que se identifica la presencia del responsable de COVID-19.

      Los mismos desarrolladores tienen que tener en cuenta que con el tiempo si el virus muta los cebadores de la PCR seleccionados inicialmente pueden dejar de ser los óptimos. Dependerá de si el cambio producido afecta a la unión al ADN o no. Si es que sí, en ese caso, se diseñarían nuevos cebadores. Al igual que los virus cambian, las pruebas de detección van evolucionando para adaptarse a la situación.

      ¡Un saludo!

  15. Paola dice:

    Hola excelente publicacion… Pero quiero saber di positivo ase quince días sin nada de síntomas, me hicieron el PCR 10 días después y me pone Deteccio SARS-Cov2 (POSITIU) y no tengo nada de síntomas no me duele nada, ni fiebre.. Etc…. Puede q sea un falso positivo y q pasara ahora tendré q seguir encerrada sin síntomas encontrándome bien….

    • Rubén Megía González (Coordinador del área de formación) dice:

      Buenos días Paola,

      Existen casos asintomáticos, en los que la persona que padece la enfermedad no se ve afectada de ninguna forma, pero sí puede transmiir la enfermedad a otros. Lo mejor es que se quede en su domicilio, aislada del contacto directo con otras personas, para evitar que se contagien. Para salir de dudas, vuelva a solicitar la prueba en unos días y consulte con su médico.

  16. Victor Gonzalez dice:

    hola buenas Tardes, me hiceron la prueba y los resultados fueron los siguientes: Cov Gen E positivo y Cov Gen RdRp Negativo, que significa. no tengo sintomas y ya han pasado 7 dias de haberme hecho la prueba. Que significa eso? si tengo el virus o la prueba esta mala? Gracias.
    Nota: La prueba me la realizaron por requisitos en mi lugar de trabajo.

    • Rubén Megía González (Coordinador del área de formación) dice:

      Buenos días Víctor,

      Por lo general, un resultado se considera positivo si ambas son positivas. Puede que no se haya apmplificado el gen RdRp por algún fallo procedimental o en los primers. Lo mejor es que consulte con la persona encargada de realizar estos análisis y, en caso de ser necesario, repita la prueba.

      Por el momento, puesto que no es concluyente, evite el contacto directo con otras personas, como si se tratase de un positivo.

    • Amparo Tolosa (Coordinadora de Contenido Editorial) dice:

      Hola Victor:
      Te recomendamos que consultes la guía https://genotipia.com/guias/covid-19-tecnicas-de-deteccion/ para saber más sobre la detección del coronavirus.
      Si la prueba incluye dos genes del coronavirus y solo uno resulta positivo, es posible que sea inconcluyente (es decir, que no se pueda llegar a una conclusión sobre la detección del virus) y haya que repetirla. Nuestra recomendación es que consultes a los que te realizaron la prueba. En el informe de resultados debería explicarse qué significa lo que se ha obtenido.

      ¡Un saludo!

  17. Cecil dice:

    Buenas, en Argentina se ha desarrollado en conjunto con 3 científicos de 3 Universidades, un kit que utiliza el sistema Easy Loop Amplification, es un kit que amplifica el ARN del genE del COVID. No se necesita RT-PCR, ya fue aprobado por el ANMAT, tiene una sensibilidad del 96% y una especificidad del 100%. Ya hay varios laboratorios que lo están utilizando, nosotros lo incorporaremos próximamente en nuestro laboratorio.
    Saludos desde Argentina

    Cecil Alvarez
    Licenciada en Biología Molecular

  18. Gofioman dice:

    Buenas, a mi modo de entender, creo que se comente un error y un sesgo de confirmación.
    Cito: “Como os comentaba en el post anterior sobre la técnica de la PCR, la PCR cuantitativa es una variante de la PCR que nos permite medir en tiempo real la cantidad de fragmentos de ADN que se van produciendo. Para poder cuantificar la muestra de un paciente en este tipo de PCR, se añaden al tubo de ensayo sondas que se unen únicamente a secuencias específicas del ADN retrotranscrito del virus y emiten fluorescencia. Por tanto, a mayor fluorescencia en la muestra, mayor cantidad de copias del ADN obtenido mediante la retrotranscripción del virus SARS-CoV-2.”

    Lo que se obtiene es una retrotranscripción de la “muestra”, no del virus. Ahí veo el error.
    Estás buscando pruebas o indicios de la presencia del virus a través de una muestra genérica que puede y de hecho va a contener restos de ADN/ARN de otros orígenes como bien reconocéis más arriba. La prueba no es concluyente porque lo que confirma es la presencia de una cadena específica de ADN/ARN presente en el coronavirus por no exclusiva ni específica de él.
    El positivo depende de un cambio de coloración, un resultado cuantitativo y cualitativo, es decir, de origen incierto.
    Se deduce la posible presencia del virus a partir de esa detección, pero es sólo una deducción.
    Es como poner una cámara web para detectar el tráfico: ¿Pasan coches o no pasan coches? … ¿son muchos o pocos? ¿Cuantos son rojos? Pues mira, pasan muchos coches pero mi cámara es en blanco y negro.

    Posiblemente por mi ignorancia cometa muchos errores pero es lo que “deduzco” de vuestro artículo y muchos otros que he leído respecto al tema y el porqué la tasa y lo que es peor, la horquilla tan amplia en al tasa de error que daba de un 7,3% en los test iniciales sobre 37 pacientes confirmados dando 3 de ellos negativo, y otras que llegaron a tasas de error del 37%, así y todo se le dio paso por la necesidad imperiosa de tener una prueba rápida aunque fuese realmente inconsistente.

    Un saludo.-

    • Gofioman dice:

      “El positivo depende de un cambio de coloración, un resultado cuantitativo y cualitativo, es decir, de origen incierto.”

      Perdón, quise decir “El positivo depende de un cambio de coloración, un resultado cuantitativo y no cualitativo, es decir, de origen incierto.”

    • Genotipia dice:

      Buenos días:

      Efectivamente, como comentas cuando se realiza la retrotranscripción de la muestra se obtiene ADN de diferentes orígenes y no únicamente del SARS-CoV-2. La “magia” (o más bien “ciencia”) viene después, pues la PCR o amplificación es específica para la secuencia retrotranscrita del SARS-CoV-2. Esto quiere decir que, aunque tengamos ADN de origen bacteriano, humano o de otros virus, solo se va a amplificar (multiplicar) la secuencia del SARS-CoV-2. Por tanto, si vemos que se amplifica la muestra (de la cual sólo se amplificará la secuencia específica del coronavirus), significa que el paciente está infectado con SARS-CoV-2.

      Es como si vamos a una biblioteca con una foto de un libro, para identificarlo y una vez encontramos ese libro concreto hacemos miles de copias del mismo. Hasta aquí es la PCR. Para ver qué ocurre cuando es cuantitativa, podemos pensar que las nuevas copias del libro están impresas en papel azul, lo que las diferencia del resto. Si tuviéramos una máquina (como tenemos para cuantificar los resultados de la PCR) que detecte libros impresos en papel azul, podríamos cuantificar cuántos libros se producen. En el caso de la máquina de PCR cuantitativa, se han establecido valores de fluorescencia para cada concentración de ácidos nucleicos, por lo que se puede cuantificar de forma bastante precisa. Y decimos bastante, porque obviamente, no sabremos si hay 5 999 999 copias o 6 000 000, pero sí sabremos si hay 5 000 000 o 5 100 000, por ejemplo. No es una medida de sí o no.

      Siguiendo el símil que haces con el control del tráfico, pongamos que el coronavirus son los coches rojos. La cámara de la que hablas (la PCR) es específica: ve de forma nítida si hay coches rojos o no, pero el resto de coches azules, amarillos, negros, etc, no los ve. Se centra solo en los “coches rojos” y obvia cualquier otro vehículo de cualquier otro color. Porque está diseñada para detectar coches rojos.

      La detección mediante PCR cuantitativa en laboratorio es muy específica y potente. Además en cada ensayo se realizan controles positivos y negativos para proporcionar la máxima garantía posible. Es una técnica diagnóstica ampliamente utilizada en el ámbito clínico, no solo para el coronavirus sino para otras situaciones.

      Esperamos haber aclarado tus dudas.

      ¡Un saludo!

  19. Luciano dice:

    Buenas tardes. A continuacion detallo lo que me dio el resultado del hisopado, seria positivo??

    “RESULTADO:
    Detectable

    Esta reacción detecta presencia de ARN de Coronavirus SARS-CoV-2. El periodo de incubación es de 7-10 días durante el cual la presencia de ARN viral puede estar ausente.

    Ct (Cycle threshold):
    30,1

    Interpretación: El valor de Ct se relaciona inversamente con la carga viral. Un aumento de aproximadamente 3.3 en el valor del mismo refleja una reducción de 10 veces en la carga inicial.”

    • Genotipia dice:

      Buenos días:

      Desde Genotipia, como plataforma de comunicación, no podemos interpretar resultados de pruebas genéticas ni hacer diagnósticos.

      Los resultados deben ser interpretados según indican las instrucciones de la prueba concreta, como indicará en el prospecto del kit proporcionado por la empresa que lo ha fabricado. En él debería indicarse qué genes virales o control se analizan y qué valores de Ct indican resultado positivo para la prueba. Algunos tests consideran resultado positivo cuando el Ct es menor de 37, pero desconocemos cuál es el valor umbral en la prueba que le han hecho. Cuanto más bajo es el Ct, mayor es la carga viral detectada en la muestra.

      Según nos indica, el resultado de la prueba es “detectable”, lo que ciertamente es un poco ambiguo y la interpretación que ofrece no está clara. Partiendo de la información que proporciona, nuestra recomendación es que tome las medidas de actuación y prevención correspondientes a un resultado positivo y consulte al personal que ha solicitado o realizado su prueba.

      ¡Un saludo!

  20. Maria del Carmen Noya dice:

    Buenas tardes, el 07 de junio mi cuñada se hizo la prueba Elisa y le dió Igm 2.32positivo y la Igg 1.26 PositivoIgm sin síntomas, el 08 de junio se hizo una PCR en la que le sale NEGATIVO, posteriormente el 23 de junio le salió la Igm 0.09 y la Igg 1.24.¿Como se puede interpretar al final ? Es muy confuso. Por otro lado,¿ se puede hacer vacunar? Muchas gracias por su orientación y ayuda

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