Recursos e información sobre el coronavirus SARS-CoV-2

Genotipia

 

La pandemia de COVID-19 ha transformado el mundo. Y también está generando un aluvión de información, no solo científica o clínica sino también relativa a cuestiones sociales o ambientales.

A continuación presentamos una selección de recursos informativos y científicos útiles.

 

información coronavirus
Imagen de partículas del virus SARS-CoV-2 emergiendo de una célula infectada. Imagen: National Institute of Allergy and Infectious Diseases.

GENERALES

 

Outbreak.info

Portal que incluye información de todo tipo sobre SARS-CoV-2 y COVID-19. Tiene dos apartados principales: uno de recursos donde se pueden buscar publicaciones, ensayos clínicos, protocolos… y otro de epidemiología donde se pueden obtener mapas de incidencia por países, comparativas entre países…

 

NCBI

Portal de recursos del Centro Nacional de Información en Biotecnología del Instituto Nacional de Salud de EE.UU. Contiene datos de secuenciación, literatura científica, y enlaces a otras webs de interés.

 

Centro Nacional de Bioinformación de China

Versión inglesa del portal del Centro Nacional de Bioinformación de China, que incluye un repositorio de secuencias de coronavirus, información sobre variación genética del mismo, herramientas de diagnóstico y un apartado de literatura, entre otros.

 

Información general proporcionada por instituciones

OMS – Página informativa de la OMS sobre COVID-19.

Ministerio de Sanidad. Gobierno de España

Centro de Prevención y Control de Enfermedades de EE.UU.

 

RECURSOS SOBRE EL GENOMA, ESTRUCTURA O CARACTERÍSTICAS DE SARS-CoV-2

 

The UCSC SARS-CoV-2 Genome Browser

Una de las herramientas más utilizadas por aquellos que trabajan en genómica y genética es el UCSC Genome Browser, un navegador de internet que permite visualizar diferentes características de los genomas de diversas especies, incluida la humana.

Recientemente se ha creado la versión correspondiente a SARS-CoV-2, que contiene información variada sobre la estructura de su genoma, proteínas codificantes, conservación respecto a otros virus cercanos…

 

COVID-3D

Esta herramienta permite visualizar las mutaciones identificadas en SARS-CoV-2 en el contexto tridimensional de las proteínas a las que afectan. Su objetivo es facilitar el estudio del virus y la identificación de fármacos que interaccionen con las proteínas del virus.

 

Coronavirus-3D

Herramienta similar a la anterior, que ofrece una visualización de las variantes identificadas de SARS-CoV-2

 

GISAID

Principal repositorio público de secuencias de SARS-CoV-9 (más de 4500), incluye visualizaciones de Nextstrain sobre epidemiología genómica: cómo la especie humana ha dispersado el virus por todo el mundo y cómo ha ido evolucionando el genoma viral en el tiempo.

Incluye también enlace a la información actualizada sobre la incidencia de casos y muertes de COVID-19 proporcionada por el Centro de Ingeniería y Ciencias de Sistemas de la Universidad Johns Hopkins.

 

Portal del EMBL-EBI

Repositorio europeo de información sobre SARS-CoV-2. Incluye secuencias del virus, datos de estructura, expresión…y publicaciones científicas.

 

 

EPIDEMIOLOGÍA

 

Imagen de una célula (azul) infectada con partículas de SARS-CoV-2 aisladas de un paciente de COVID-19. Imagen: NIAID Integrated Research Facility (IRF), Fort Detrick, Maryland. CC BY 2.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/2.0/).

Tablón informativo de COVID-19 del Centro de Ingeniería y Ciencias de Sistemas de la Universidad Johns Hopkins.

Ya hemos mencionado que la Universidad Johns Hopkins publica información actualizada sobre el número de casos de COVID-19 identificados en cada país. Este es el enlace directo al sitio web. Como dato interesante, es posible bajarse la aplicación para tener acceso desde el móvil. Así como para donar para mantener el sitio web.

 

Centro Europeo de Control y Prevención de Enfermedades

 

Centro de Control de Enfermedades y Prevención de EE.UU.

 

INVESTIGACIONES y PUBLICACIONES CIENTÍFICAS

 

LitCovid

Portal de publicaciones sobre SARS-CoV-2 y COVID-19, que incluye diferentes apartados: general, mecanismos, transmisión, diagnóstico, tratamiento, prevención, casos, previsiones.

 

Preprints sobre COVID-19 y SARS-CoV-2

En este enlace se encuentran disponibles manuscritos enviados a las plataformas bioRxiv y medRxiv que tratan temas relacionados con COVID-19 y SARS-CoV-2. Es importante hacer notar, que se trata de manuscritos preliminares que no han sido revisados por expertos en el tema y por lo tanto no pueden considerarse como concluyentes o definitivos. No obstante, pueden ser un recurso interesante para ver investigaciones o resultados preliminares así como tendencias de investigación.  Algunos de los artículos son publicados después con más o menos modificaciones en revistas científicas que ya han utilizado la revisión por pares para evaluar su contenido y calidad

 

Secciones de revistas científicas conocidas

 

ENSAYOS CLÍNICOS Y TRATAMIENTOS

 

Clinicaltrials.gov

Portal de ensayos clínicos sobre COVID-19 de en EE.UU.

EU Clinical Trials

Portal de ensayos clínicos de la Unión Europea

Agencia Española de Medicamentos y productos sanitarios

Página que incluye información sobre ensayos clínicos y estudios observacionales aprobados en España.

 

DESARROLLO DE VACUNAS

 

OMS

La Organización Mundial de la Salud actualiza periódicamente la lista de vacunas potenciales para COVID-19 según su estado de desarrollo.

Coronavirus Vaccine Tracker de The New York Times

Agencia Europea de Prevención y Control de COVID-19

 

NOTICIAS DE CIENCIA

 

La mayor parte de los medios de comunicación y muchos buscadores de noticias tienen secciones dedicadas a COVID-19. Aquí te ofrecemos algunas:

 

IMÁGENES DE SARS-CoV-2

 

National Institute of Allergy and Infectious Diseases

 

 

Esta es una pequeña selección de recursos y lugares donde obtener información sobre el coronavirus y COVID-19. Hay muchos más. Por ejemplo, puedes descubrir algunos en: https://datascience.nih.gov/covid-19-open-access-resources

 

 

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