Institutos Nacionales de Salud, EE.UU.
Un estudio detalla la escala, diversidad y poder sin precedentes del Programa de Investigación All of Us.
Investigadores de diferentes instituciones han descubierto más de 275 millones de variantes genéticas no reportadas previamente, identificadas a partir de los datos compartidos por casi 250.000 participantes en el Programa de Investigación All of Us de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) de EE.UU. La mitad de los datos genómicos proceden de participantes con ascendencia genética no europea. Este conjunto inexplorado de variantes ofrece a los investigadores nuevas vías para comprender mejor las influencias genéticas en la salud y la enfermedad, especialmente en comunidades que han quedado al margen de la investigación en el pasado. Los hallazgos se detallan en Nature, junto con otros tres artículos en revistas Nature.
Casi 4 millones de las nuevas variantes identificadas se encuentran en áreas que pueden estar relacionadas con el riesgo de enfermedad. Los datos genómicos detallados en el estudio están a disposición de los investigadores registrados en el Researcher Workbench, la plataforma del programa para el análisis de datos.
«Como médico, he visto el impacto que la falta de diversidad en la investigación genómica ha tenido en la acentuación de las disparidades sanitarias y la limitación de la atención a los pacientes», ha señalado Josh Denny, director ejecutivo del Programa de Investigación All of Us y uno de los autores del estudio. «El conjunto de datos All of Us ya ha llevado a los investigadores a descubrimientos que amplían lo que sabemos sobre la salud, muchos de los cuales no habrían sido posibles sin la contribución de nuestros participantes con su ADN y otra información sanitaria. Su participación está marcando el rumbo hacia un futuro en el que el descubrimiento científico sea más inclusivo, con mayores beneficios para todos.»
Hasta la fecha, más del 90% de los participantes en grandes estudios genómicos han sido de ascendencia genética europea. Los directores de los institutos y centros de los NIH señalan en un artículo de opinión publicado en Nature Medicine que esto ha llevado a una comprensión limitada de la biología de las enfermedades y ha impedido el desarrollo de nuevos tratamientos y estrategias de prevención para todas las poblaciones. Destacan que muchos investigadores utilizan ahora el conjunto de datos All of Us para avanzar en la medicina de precisión para todos.
Por ejemplo, en un estudio complementario publicado en Communications Biology, un equipo de investigación dirigido por el Baylor College of Medicine de Houston revisó la frecuencia de genes y variantes recomendados por el American College of Medical Genetics and Genomics en los distintos grupos de ascendencia genética del conjunto de datos All of Us. Estos genes y variantes reflejan los correspondientes de los resultados de la investigación del programa Riesgo de Enfermedades Hereditarias ofrecidos a los participantes. Los autores hallaron una variabilidad significativa en la frecuencia de variantes asociadas al riesgo de enfermedad entre los distintos grupos de ascendencia genética y en comparación con otros grandes conjuntos de datos genómicos.
Aunque se necesita más investigación antes de que estos resultados puedan utilizarse para adaptar las recomendaciones de pruebas genéticas a poblaciones específicas, los investigadores creen que la diferencia en el número de estas variantes puede estar influida por la diversidad limitada de los estudios anteriores y su enfoque centrado en la enfermedad para la inscripción de los participantes, en lugar de una diferencia en la prevalencia de las variantes.
En otro estudio, los investigadores utilizaron el conjunto de datos All of Us para calibrar y aplicar 10 puntuaciones de riesgo poligénico de enfermedades comunes en diversos grupos de ascendencia genética. Estas puntuaciones calculan el riesgo de enfermedad de un individuo teniendo en cuenta factores genéticos y antecedentes familiares. Sin tener en cuenta la diversidad, las puntuaciones de riesgo poligénico podrían dar lugar a resultados falsos que falsearían el riesgo de enfermedad de una persona y crearían herramientas genéticas no equitativas. Gracias a la diversidad de los datos de All of Us , estas puntuaciones de riesgo poligénico son aplicables a una población más amplia.
«All of Us valora la implicación intencionada de la comunidad para garantizar que las poblaciones históricamente infrarrepresentadas en la investigación biomédica también puedan beneficiarse de los futuros descubrimientos científicos», afirma Karriem Watson, doctora en ciencias, máster en ciencias y máster en salud pública, directora de implicación del Programa de Investigación All of Us. «Esto empieza por concienciar y mejorar el acceso a la investigación médica para que todo el mundo tenga la oportunidad de participar».
Hasta la fecha, más de 750.000 personas se han inscrito en All of Us. Con el tiempo, el programa prevé la participación de al menos un millón de personas que reflejen la diversidad de Estados Unidos y aporten datos de ADN, historiales médicos electrónicos, dispositivos portátiles, encuestas, etc. El programa amplía y actualiza periódicamente el conjunto de datos a medida que más participantes comparten información.
Artículos científicos:
The All of Us Research Program Genomics Investigators. Genomic data in the All of Us Research Program. Nature. 2024. DOI: https://doi.org/10.1038/s41586-023-06957-x
Bianchi, D.W., Brennan, P.F., Chiang, M.F. et al. The All of Us Research Program is an opportunity to enhance the diversity of US biomedical research. Nat Med 30, 330–333. 2024. DOI: https://doi.org/10.1038/s41591-023-02744-3
Venner, E., Patterson, K., Kalra, D. et al. The frequency of pathogenic variation in the All of Us cohort reveals ancestry-driven disparities. Commun Biol 7, 174. 2024. DOI: https://doi.org/10.1038/s42003-023-05708-y
Lennon, N.J., Kottyan, L.C., Kachulis, C. et al. Selection, optimization and validation of ten chronic disease polygenic risk scores for clinical implementation in diverse US populations. Nat Med 30, 480–487. 2024. DOI: https://doi.org/10.1038/s41591-024-02796-
Más información sobre el programa All of Us:
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