Medicina neonatal: el genoma completo tiene mayor rendimiento
Amparo Tolosa, Genotipia
Un reciente estudio multicéntrico revela que en niños hospitalizados con sospecha de enfermedad genética, la secuenciación rápida del genoma completo duplica en rendimiento diagnóstico a los paneles de genes. No obstante, obtener la información completa del genoma también requiere más tiempo hasta obtener los resultados.
Desde hace unas décadas la genética ha transformado la forma de diagnosticar y tratar muchas enfermedades. Los avances en las estrategias diagnósticas están permitiendo analizar cada vez mayores cantidades de información genética en una única prueba. Un paso esencial es determinar qué estrategia tiene mayor rendimiento en un contexto clínico concreto.
Desde hace cuatro años el estudio GEMINI (Medicina Genómica para Infantes y Neonatos Enfermos) tiene como objetivo comparar dos estrategias diagnósticas ampliamente utilizadas: la secuenciación de genomas completos, que analiza el material hereditario completo de una persona, y un panel de 1722 genes seleccionados relacionados con trastornos genéticos en neonatos e infantes.
Los resultados del estudio, publicados recientemente en la revista JAMA apuntan a la secuenciación genómica como aproximación con mayor capacidad para detectar mutaciones responsables de la patología. No obstante, también reconocen sus limitaciones.
“Este estudio proporciona evidencias adicionales de que los trastornos genéticos son comunes entre niños e infantes”, ha señalado Stephen F Kingmore, presidente y CEO del Instituto Rady de Niños para Medicina Genómica y uno de los investigadores del estudio. “Los resultados apoyan el diagnóstico temprano mediante secuenciación genómica rápida, permitiendo el uso de la medicina de precisión para mejorar la atención de esta población de pacientes vulnerables”.
Diagnóstico para la mitad de pacientes
El estudio GEMINI reclutó 400 recién nacidos y niños menores de un año con síntomas que hacían pensar en posibles trastornos genéticos como causa. A cada paciente se realizó un análisis de genoma completo, así como una prueba genética que evalúa 1722 genes relacionados con trastornos genéticos en la infancia.
El análisis de genoma completo detectó un posible trastorno genético en casi la mitad de los pacientes (el 49%), mientras que el panel de genes seleccionados identificó trastornos genéticos en el 27%. Estos resultados derivaron en cambios en la atención clínica en un 19% de los pacientes.
A nivel de variantes genéticas identificadas con un método pero no con el otro, los investigadores encontraron que la secuenciación del genoma no detectó 19 variantes encontradas a través del análisis de paneles y esta última estrategia no detectó 164 variantes identificadas mediante secuenciación del genoma completo.
“Más de la mitad de los bebés de nuestro estudio tenían un trastorno genético que habría permanecido indetectado en la mayoría de los hospitales del país, si no fuera por las tecnologías de secuenciación de genomas”, ha destacado Jonathan Davies, Jefe de Medicina Neonatal en el Centro Médico de Tufts y director del estudio. “Diagnosticar con éxito el trastorno genético de un niño tan pronto como es posible ayuda a asegurar que reciben la mejor atención médica. Este estudio muestra que la secuenciación del genoma completo, aunque todavía imperfecta, se mantiene como el estándar de oro para el diagnóstico preciso de trastornos genéticos en neonatos e infantes”.
El genoma completo tiene mejor rendimiento con algunas limitaciones importantes
El trabajo reconoce la secuenciación de genomas completos como aproximación con mayor rendimiento diagnóstico. No obstante, también implica algunas limitaciones a considerar.
La primera de las limitaciones es el tiempo necesario hasta obtener los resultados. Al menos en los casos no urgentes. La mediana de tiempo hasta recibir el informe fue de 6.1 días en el caso del análisis del genoma, frente a los 4 días del panel de genes. Y en los casos urgentes, 3.3 días para el análisis del genoma y 4 días para el panel de genes.
Otro aspecto a mejorar detectado por los investigadores es la falta de estándares a la hora de interpretar los resultados de las pruebas genéticas en neonatos. En cuatro de cada 10 casos hubo discrepancias entre laboratorios sobre si ciertas variantes genéticas eran la causa de la enfermedad del niño.
Además, el análisis de genomas completos es una aproximación más costosa, lo que puede ser una limitación importante a la hora de su implementación en centros con menos recursos.
Artículo científico: Maron JL, et al. Rapid Whole-Genomic Sequencing and a Targeted Neonatal Gene Panel in Infants With a Suspected Genetic Disorder. JAMA. 2023 Jul 11;330(2):161-169. doi: http://dx.doi.org/10.1001/jama.2023.9350
Fuente: Genome Sequencing Nearly Twice as Effective as a Targeted Gene-Sequencing Test at Diagnosing Genetic Disorders in Newborns and Infants. https://www.tuftsmedicalcenter.org/News-Events-Media/Press-Releases/2023/Genome-Sequencing-Nearly-Twice-as-Effective-as-Targeted-Gene-Sequencing-Test
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